सुधीरन ने अपने इस्तीफा के बारे में कहा कि वह निजी कारणों से इस्तीफा दे रहे हैं और इस आशय का पत्र भी हाईकमान को भेज दिया। गौरतलब है कि कुछ दिनों पूर्व कालीकट में एक दुर्घटना के बाद उन्हें अस्पताल में भर्ती किया गया था । उसके बाद डॉक्टरों ने उन्हें स्वास्थ्य लाभ लेने और इलाज के बारे में कहा। इसी वजह से सुधीरन ने इस्तीफा दिया। उन्होने कहा कि जब वे पार्टी के कामकाज को ठीक तरीके से अभी नहीं कर पाएंगे उस स्थिति में यह कमान किसी और को दी जाए।
साल 2014 में जब सुधीरन केरल प्रदेश कांग्रेस कमेटी के अध्यक्ष हुए,तब से तत्कालीन गृहमंत्री रमेश चेन्नित्तला और मुख्यमंत्री ओमन चांडी से कई विषयों में मतभेद रहे हैं और कभी- कभी यह खुलकर सामने आये । इसको लेकर विवाद भी उठ खड़े हुए हैं ।
